参照、照合という意味。たとえばプログラム言語処理系のリファレンスマニュアルなら、言語仕様を一覧にしたものがリファレンスマニュアルとなる。また使い方として、ハードウェアやソフトウェアの機能一覧を解説したマニュアルの意味としても使われる。